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// Resivimos nuestra sequencia
$seq = $_POST['sequence'];
// Pasamos a mayusculas nuestra secuencia
$seq = strtoupper($seq);
// Generamos numero aleatorio
$random = rand(1, 1000);
// Creamos archivo con nombre aleatorio donde guardamos nuestra secuencia
$file = fopen($random, "x");
fwrite($file, $seq);
fclose($file);
// Linea de ejecución de nuestro programa (programa db sequencia)
$command = "hmmpfan hmm_db " . $random;
// Imprimimos en pantalla nuestros resultados
$output = shell_exec($command);
echo "<pre>" . $output . "</pre>";
?>